ファイルを圧縮したときのアイコンが、ウインドウズマークになってしまいます。自己解凍ファイルの時は、ちゃんと書庫のアイコンになるのですが・・・。どのバージョンか忘れましたが、バージョンアップしたときからです。拡張子は正常で、機能も正常です。同じものを会社でも使っていますが、ちゃんと書庫のアイコンになります。
原因は Windows のアイコンキャッシュの問題だと思われます。 もう一度インストーラを起動して、単にそのまま「OK」ボタンを押してみてください。 それでもなお、他のアイコンで表示されたまま…という場合は、 Winowsキーを押しながら、R ボタンを押して「ファイル名を指定して実行」 ダイアログを表示し、下記のように ie4uinit -show を実行してください。 FOSSBYTES(英語)の説明も参考になります。